汉诺威96成立于1896年4月12日，初期只是地区联赛俱乐部，经过与多间俱乐部合并，于1935年正式参与国家级联赛。二次大战时曾一度被迫解散，直到1945年才重新组班。1963年德甲联赛成立，汉诺威96被编在乙组联赛作赛。
　　七十年代时这家俱乐部曾受到财政问题困扰，一度在低组别联赛打滚。1990年汉诺威96又一次出现财困，幸而在1992年赢得了德国杯冠军，才止住了破产危机。这届德国杯汉诺威96先后对着多特蒙德、波鸿、卡尔斯鲁厄、云达不来梅和门兴格拉德巴赫 ，乃首支德国低组别俱乐部赢得这个杯赛冠军。
　　但汉诺威96一直要到十年后，2001/02赛季，球队才能重新升上甲组并一直在甲组做赛至今。
　　2015/16赛季球队的球衣赞助商是德国本土品牌Jako。